第十六章 GCCGCCAGTTCC(1/3)

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  傍晚,他被接二连三的电话吵醒。三家测序公司全都散发着大号拖延症的气质,像是约好了一样,在承诺时效的前一天晚上才和他沟通。

  沟通的内容无非就是怀疑样本被污染了,所以提前声明不对测序结果的解读负责。

  卢赫见怪不怪地一顿“嗯嗯啊啊好好好”迅速把他们都给打发了,随后邮箱被测序报告塞满。

  他从床上爬起来,穿戴整齐,甚至用梳子蘸水梳了头发。

  随后他郑重地走下楼,走进细胞间,一屁股坐在电脑前,伸手去手捞椅背,把正在忙碌的菜菜一把拽了过来。

  “歇会儿歇会儿,陪我吃瓜。”

  这次他们率先打开了基因组原始数据。基准30亿个碱基对,有效分析了30亿个碱基对。GC含量57%。

  怎么还是这么高?

  两人的脑袋凑在一起,紧盯着屏幕上缓缓滑过的密密麻麻的字符。这次依然是满屏的红和绿,但红多绿少。

  “停!”菜菜指着刚掠过的一段字符惊呼,“你看这段,GCCGCCAGTTCC,这不是终止子吗?”

  卢赫定睛一看,“是啊,这是转录终止修饰点,而且是依赖Rho因子[1]的的转录终止。”

  “终止,好多终止,全是终止!”菜菜又一次惊呼,“停!这段,GC区[2]下游怎么没有TATA区[3]啊。我只知道组蛋白可以没有GC区,这没有TATA区的是什么鬼啊?”

  鼠标继续翻动,两人逐渐陷入沉默。

  许久之后,卢赫打破了这死寂的气氛,但从他嘴里说出的并不是菜菜所期待的正经话。

  “真是离谱他妈给离谱开门,离谱到家了。”他边感慨边点开了刚刚下载好的线粒体基因,在软件加载期间合了好几下眼。

  软件加载完成,线粒体基因没有太多注释,可翻了几下后,两人还是犹如半截木头般僵在那里。从地下室天窗投射出的一缕橙红色的阳光,缓缓从卢赫的脸上掠过,他连眼睛都没眨一下。

  渐渐的,天色完全暗下来,电脑屏幕上反射出天花板上白炽灯管的轮廓,正好遮挡住屏幕的正中央。

  “GGAGGGCGAGGCTCCGTCCTAGCCTTG。。。”卢赫偏了偏头,默念着其中的一段碱基序列,重启电脑进了Linux,然后在命令行下快速敲击。

  一顿操作下来,他揉着脖子对着黑色背景下一格一格往前爬的亮白色进度条沉思。一旁的菜菜眯着眼睛念出命令行中的小字:“CRISPR。。。Cas。。。Finder?你不会真以为他会有CRISPR系统吧?这太荒诞了。”

  卢赫揉乱了自己的头发,“葫芦上藤上结南瓜。咱们搞研究的,总得有点儿想象力吧。”

  不一会儿,软件装好了。他在命令行敲出一大行命令:perl -in -out Stupid_Turtle_crispr_cas -def General -cas -ccvr -ccc -gscf -keep -html -cpuM 32 -cpuP 32 -xr 555 -md 50 -t 50

 

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